Analyse d'un job avec accès à un SE distant

Ce tutoriel décrit comment exécuter un job sur le CE du LPSC en utilisant des données sur un SE distant.

Pour lancer un job, vous avez besoin de deux fichiers

• Le fichier JDL (Job Description Langage) Le fichier job.jdl est le fichier qui décrit votre job. Dans ce fichier vous trouverez une ligne de commentaire (#...) qui décrit chaque nouvelle instruction du fichier JDL.
• L'executable Le fichier job.sh est le script qui va être exécuter sur la machine distante (le WN)

Utiliser un dataset == Le dataset utilisé est valid1.007000.singlepart_e_Et10.bstream.BS.e322_s412_b25. Notez les guid des deux premiers fichiers qu'il contient

 [lambert@lpsc-ui JDL_InputSandBox_remote_gsiftp]$ dq2-list-files valid1.007000.singlepart_e_Et10.bstream.BS.e322_s412_b25
...
BS.021085._00013.data.1         c3e3acf3-0728-4e5a-b9f3-9bc71fc938eb    md5:d34db6104ff44d7475d5f1957f57e89e    576129736
...

--> Exercice: Trouvez ce dataset avec AMI et cherchez à quelle type de données il correspond

Trouver les TURL des fichiers

[lambert@lpsc-ui JDL_InputSandBox_remote_gsiftp]$ lcg-lr guid:c3e3acf3-0728-4e5a-b9f3-9bc71fc938eb
srm://ccsrm.in2p3.fr/pnfs/in2p3.fr/data/atlas/atlasmcdisk/valid1/BS/valid1.007000.singlepart_e_Et10.bstream.BS.e322_s412_b25_tid021085/BS.021085._00013.data.1

[lambert@lpsc-ui JDL_InputSandBox_remote_gsiftp]$ lcg-gt srm://ccsrm.in2p3.fr/pnfs/in2p3.fr/data/atlas/atlasmcdisk/valid1/BS/\
valid1.007000.singlepart_e_Et10.bstream.BS.e322_s412_b25_tid021085/BS.021085._00013.data.1 gsiftp
gsiftp://ccxfer13.in2p3.fr:2811//pnfs/in2p3.fr/data/atlas/atlasmcdisk/valid1/BS/valid1.007000.singlepart_e_Et10.bstream.BS.e322_s412_b25_tid021085/BS.021085._00013.data.1

-->Exercice: Ouvrez et analysez le fichiers job.jdl. Essayer de le modifier pour utiliser deux autres fichiers de votre choix.

Soumission du job et résultat

[lambert@lpsc-ui gliteWMS5]$ glite-wms-job-submit -a job.jdl

Connecting to the service https://wms105.cern.ch:7443/glite_wms_wmproxy_server


====================== glite-wms-job-submit Success ======================

The job has been successfully submitted to the WMProxy
Your job identifier is:

https://lb105.cern.ch:9000/DLadyaUWPDqFDqCeHuLlsA

==========================================================================

[lambert@lpsc-ui gliteWMS5]$ glite-wms-job-status https://lb105.cern.ch:9000/DLadyaUWPDqFDqCeHuLlsA


*************************************************************
BOOKKEEPING INFORMATION:

Status info for the Job : https://lb105.cern.ch:9000/DLadyaUWPDqFDqCeHuLlsA
Current Status:     Done (Success)
Logged Reason(s):
    - 
    - Job terminated successfully
Exit code:          0
Status Reason:      Job terminated successfully
Destination:        lpsc-ce.in2p3.fr:2119/jobmanager-pbs-atlas
Submitted:          Tue May 27 17:04:50 2008 CEST
*************************************************************

[lambert@lpsc-ui gliteWMS5]$ glite-wms-job-output  https://lb105.cern.ch:9000/DLadyaUWPDqFDqCeHuLlsA

Connecting to the service https://wms105.cern.ch:7443/glite_wms_wmproxy_server


================================================================================

                        JOB GET OUTPUT OUTCOME

Output sandbox files for the job:
https://lb105.cern.ch:9000/DLadyaUWPDqFDqCeHuLlsA
have been successfully retrieved and stored in the directory:
/tmp/lambert_DLadyaUWPDqFDqCeHuLlsA

================================================================================

[lambert@lpsc-ui gliteWMS5]$ cat /tmp/lambert_DLadyaUWPDqFDqCeHuLlsA/std.out
Fichier:
BS.021085._00013.data.1
Liste des fichiers sur le WN:
BS.021085._00013.data.1
https_3a_2f_2flb105.cern.ch_3a9000_2fDLadyaUWPDqFDqCeHuLlsA.output
job.sh
std.err
std.out
tmp.IgNVS14151

--> Exercice : Vérifiez que le fichier de données a bien été rapatrié sur le WN
--> Exercice : Quels autres fichiers trouvez vous sur le WN ? Cela correspond il aux instructions votre job.jdl et votre job.sh ?

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